Paulina Bull

Fono oficina: (56-2) 354-2669

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Profesor Asociado

Laboratorio de Bioquímica

Departamento de Genética Molecular y Microbiología,

Facultad de Ciencias Biológicas,

Pontificia Universidad Católica de Chile

Alameda 340, Santiago, Chile

Estudios

Bioquímico, Universidad de Chile. (1974)

Doctor en Biología Celular y Molecular, Pontificia Universidad Católica de Chile, (1980)

Post-doctorado en el Salk Institute, La Jolla, California, Estados Unidos de Norteamérica (1988 - 1989)

Especialización: Biología Celular y Molecular, Expresióngénica, control transcripcional

Premios y Distinciones

Premio “ Colegio de Químicos Farmacéuticos de Chile”, al mejor alumno de la Facultad de Ciencias Químicas (1972).
Premio “ Abate Juan Ignacio Molina”, 1980, mención Ciencia Básica, otorgado por la asociación chilena de periodismo Científico.

Cursos

Pregrado

BIO266E

Laboratorio Bioquímica II: Genética Molecular

Líneas de Investigación

La línea de investigación que he desarrollado se ha centrado en el estudio de la expresión génica, usando variados modelos.
Primero estudiamos una proteína clave en la expresión génica, la RNA polimerasa. La RNA polimerasa de E. coli y la RNA polimerasa I de levadura Saccharomyces cerevisiae fueron purificadas a homogeneidad. Estudiamos el sitio activo de ambas enzimas por modificación química, encontrando residuos de lisina y cisteína importantes para la actividad enzimática. Además, tanto el colorante azul de Cibacron como el pH ácido inactivan a la RNA polimerasa I de levadura, la cual pierde dos subunidades en el proceso. También hemos observado al microscopio las RNA polimerasas I, II y III de levadura por tinción negativa, y se aprecia un surco que probablemente corresponde al límite entre las subunidades mayores. Las tres enzimas tienen un diámetro aproximado de 13 nm.

Hemos estudiado los promotores de los genes de tRNA de levadura, a través de la transcripción in vitro de la familia de genes de tRNA de Arg y Phe usando un extracto proteico de levadura y los genes clonados. Se observa una expresión de los tRNAs que depende del contexto genético.
Mapeamos los promotores del DNA del fago PM2, usando la RNA polimerasa de BAL 31 purificada a homogeneidad, por microscopía electrónica y protección contra el corte por endonucleasa de restricción.

Hemos encontrado actividad mutagénica en cálculos vesiculares de un paciente con un quiste coledocal, y en vino tinto, a través del test de Ames. Sugerimos que esta actividad podría ser responsable de la incidencia de cáncer en nuestro país.

Hemos estudiado un factor de transcripción de organismos superiores, la proteína Rel, codificada por el proto-oncogén c-rel. Este gen fue clonado a partir de una genoteca de ratón. Se demostró, por experimentos de protección a Rnasa, que corresponde a un gen de respuesta temprana, es decir, al estimular células en reposo proliferativo con suero, los niveles de RNAm de c-rel aumentan en forma transitoria, con un máximo de expresión a la hora. Lo mismo ocurre al estimular las células con ésteres de forbol (PMA). Por otro lado, mediante experimentos de transfección en fibroblastos de ratón o transformación de levadura, demostramos que la parte carboxilo terminal de la proteína posee actividad transactivacional, mientras que la parte amino confiere capacidad regulatoria. Esto mismo lo demostramos para el proto-oncogén c-relB. Además, analizamos los niveles de expresión de c-rel en pacientes con enfermedades autoinmunes a través de un ensayo semicuantitativo de RT-PCR.

Hemos encontrado expresión del receptor de GnRH en células germinales de ratón y de rata por ensayos de Northern, sugiriendo que éste podría interactuar con GnRH o péptidos parecidas a GnRH producidos en el testículo y podría ser parte de un sistema paracrino.

Actualmente estamos estudiando la expresión de genes de xilanasas del hongo Penicillium purpurogenum por ensayos de Northern blot y unión de factores de transcripción a promotores de los genes de endoxilanasas. Estos genes son reprimidos cuando el hongo es cultivado en glucosa, e inducidos por xilano en ausencia de glucosa. Estamos caracterizando los factores de transcripción involucrados por ensayos de unión con los promotores aislados y por expresión in vivo de un gen reportero

1 - Production of a heterologus recombinant protein using fragments of the glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase promoter from Penicillium camemberti.
Autor(es): Espinosa Y, Trebotich J, Sepúlveda F, Cadena J, Vargas-Straube MJ, Vaca I, Bull P, Levican P & Chavez R

Año: 2011. 27, 3019-3023.
World Journal of Microbiology and Biotechnology
2 - The PcACE1 transcription factor from Phanerochaete chrysosporium contains a Cys- and Ser-rich transactivation domain.
Autor(es): Barham F, Roman P & P. Bull

Año: 2011. 44: 213-217.
Biological Research
3 - Synaptic clustering of PSD-95 is regulated by c-Abl through tyrosine phosphorylation
Autor(es): Perez de Arce KP, Varela-Nallar L, Farias O, Cifuentes A, Bull P, Couch BA, Koleske AJ, Inestrosa NC & Alvarez AR
Año: 2010. 30(10): p. 3728-38.
Journal of Neuroscience
4 - Reactive oxygen species potentiate the P2X2 receptor activity through intracellular Cys430
Autor(es): Coddou CJ, Li S, Lillo JG & Acuña-Castillo C
Año: 2009. 29(39):12284-91
Journal of Neuroscience
5 - The copper-dependent ACE1 transcription factor activates the transcription of the mco1 gene from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
Autor(es): Canessa P, Alvarez JM, Polanco R, Bull P & Vicuña R
Año: 2008. 154: 491-499.
Microbiology
6 - Functional analysis of the endoxylanase B (xynB) promoter from Penicillium purpurogenum.
Autor(es): Diaz J, Chavez R, Larrondo LF, Eyzaguirre J & Bull P
Año: 2008. 54:133-141.
Current Genetics
7 - Differential role of extracellular histidines in copper, zinc, magnesium and proton modulation of the P2X7 purinergic receptor
Autor(es): Acuña-Castillo C, Coddou C, Bull P, Brito J & Huidobro-Toro JP
Año: 2007. 101: 17-26.
Journal of Neurochemistry
8 - The half-life of the T-cell receptor/peptide-major histocompatibility complex interaction can modulate T-cell activation in response to bacterial challenge
Autor(es): Carreño LJ, Bueno SM, Bull P, Nathenson SG & Kalergis AM
Año: 2007. 121(2):227-37.
Immunology
9 - Dissecting the facilitator and inhibitor allosteric metal sites of the P2X4 receptor channel: critical roles of Cys-132 for zinc-potentiation and Asp-138 for copper-inhibition
Autor(es): Coddou C, Acuña-Castillo C, Bull P & Huidobro-Toro JP
Año: 2007
Journal of Biological Chemistry
10 - Penicilium purpugerum produces a family 1 acetyl xylan esterase containing a carbohydrate-binding module: characterization of the protein and its gene
Autor(es): Gordillo F, Caputo V, Peirano A, Chavez R, Van Beummen J, Vanderbergue I, Claeysenss M, Bull P, Ravanal MC & Eyzaguirre J
Año: 2006. 110: 1129-1139.
Mycological Research

11 - The xylanolytic enzyme system from the genus Penicillium
Autor(es): Chavez R, Bull P & Eyzaguirre J
Año: 2006. 123: 413-433.
Journal of Biotechnology
12 - Galectin-8 binds specific beta 1 integrins and induces polarizad spreading highlighted by asymmetric lamellipodia in Jurkat T cells
Autor(es): Carcamo C, Pardo E, Oyanedel C, Bravo M, Bull P, Caceres M, Martinez J, Massardo L, Jacobelli S, Gonzalez A & Soza A
Año: 2006. 312: 374-386.
Experimental Cell Research
13 - Extracellular histidine residues identify common structural determinants in the copper/zinc P2X2 receptor modulation
Autor(es): Lorca RA, Coddou C, Gazitua MC, Bull P, Arredondo C & Huidobro-Toro JP
Año: 2005. 95: 499-512.
Journal of Neurochemistry
14 - 4-Bromo-2,5-dimethoxyphenethylamine (2C-B) and structurally related phenylethylamines are potent 5-HT2A receptor antagonists in Xenopus laevis oocytes
Autor(es): Villalobos CA, Bull P, Saez P, Cassels BK & Huidobro-Toro JP
Año: 2004. 141: 1167-1174.
British Journal of Pharmacology
15 - The acetyl xylan esterase II gene from Penicillium purpurogenum is differentially expressed in several carbon sources, and tightly regulaterd by pH
Autor(es): Chavez R, Schachter K, Navarro C, Peirano A, Bull P & Eyzaguirre J
Año: 2004. 37: 107-113.
Biological Research
16 - Characterization of an a-L-arabinofuranosidase gene (abf1) from Penicillium purpurogenum and its expression
Autor(es): Carvallo M, de Ioannes P, Navarro C, Chavez R, Peirano A, Bull P & Eyzaguirre J
Año: 2003. 107: 488-394.
Mycological Research
17 - Histidine 140 plays a key role in the inhibitory modulation of the P2X4 nucleotide receptor by copper but not zinc
Autor(es): Coddou C, Morales B, Gonzalez J, Grauso M, Gordillo F, Bull P, Rassendren F & Huidobro-Toro JP
Año: 2003. 278: 36777-36785.
Journal of Biological Chemistry
18 - Differences in expression of two endoxylanase genes (xynA and xynB) from Penicillium purpurogenum
Autor(es): Chavez R, Schachter K, Navarro C, Peirano A, Aguirre C, Bull P & Eyzaguirre J
Año: 2002. 293: 161-168.
Gene
19 - Secretion of endoxylanase A from Penicillium purpurogenum by Saccharomyces cerevisiae transformed with genomic fungal DNA
Autor(es): Chavez R, Navarro C, Calderon I, Peirano A, Bull P & Eyzaguirre J
Año: 2002. 212: 237-241.
FEMS Microbial Letters
20 - Structure analysis of the endoxylanase A gene from Penicillium purpurogenum
Autor(es): Chavez R, Almarza C, Schachter K, Peirano A, Bull P & Eyzaguirre J
Año: 2001. 34: 217-226.
Biological Research

21 - Expression of GnRH receptor in mouse and rat testicular germ cells
Autor(es): Bull P, Morales P, Huyser C, Socias T & Castellon EA
Año: 2000. 6: 582-586.
Molecular Human Reproduction
22 - Increased expression of c-rel, from the NF-kappaB/Rel family, in T cells from patients with systemic lupus erythematosus
Autor(es): Burgos P, Metz C, Bull P, Pincheira R, Massardo L, Errazuriz C, Bono MR, Jacobelli S & Gonzalez A

Año: 2000. 27: 116-127.
Journal of Rheumatology
23 - Apical Sorting of hepatitis B surface antigen (HBsAg) is independent on N-Glycosylation and GPI-anchored protein segregation
Autor(es): Marzolo MP, Bull P & Gonzalez A
Año: 1997. 94: 1834-1839.
PNAS - Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
24 - Novel genetic markers of rheumatoid arthritis in Chilean patients revealed by DR-serotyping and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis
Autor(es): Gonzalez A, Nicovani S, Massardo L, Bull P, Rodriguez L & Jacobelli S
Año: 1992. 35: 282-289.
Arthritis and Rheumatism
25 - RelB, a new transcription activator of the Rel family which interacts with p50-NF-kB
Autor(es): Ryseck RP, Bull P, Takamiya M, Bours V, Siebenlist U, Dobrzanski R & Bravo R
Año: 1992. 12: 674-684.
Molecular & Cellular Biology
26 - The mouse c-rel protein has an N-terminal regulatory domain and a C-terminal transcriptional transactivation domain
Autor(es): Bull P, Morley K, Hoekstra M, Hunter T & Verma IM
Año: 1990. 10: 5473-5485.
Molecular & Cellular Biology
27 - Transcriptional induction of the murine c-rel gene with serum and phorbol-12-myristate-13-acetate in fibroblasts
Autor(es): Bull P, Hunter T & Verma IM
Año: 1989. 9: 5239-5243.
Molecular & Cellular Biology
28 - Binding of BAL 31 RNA polymerase to PM2 DNA as determined by electron microscopy and protection against restriction endonuclease cleavage
Autor(es): Bull P, Susaeta M, Gonzalez B & Yudelevich A
Año: 1988. 62: 3911-3913.
Journal of Virology
29 - The yeast tRNAphe gene family: structures and transcriptional activities reveal member differences not explained by intragenic promoters
Autor(es): Bull P, Thorikay M, Moenne A, Wilkens M, Sanchez H, Valenzuela P & Venegas A
Año: 1987. 6: 353-362.
DNA
30 - Factores de riesgo del cancer de la via biliar
Autor(es): Bull P and Nervi F
Año: 1987. 115: 673-679.
Revista Médica de Chile

31 - Mutagenic substances in red and white wine in Chile, a high risk area for gastric cancer
Autor(es): Bull P, Yañez L & Nervi F
Año: 1987. 187: 113-118.
Mutation Research
32 - Enfermedad de Glanzmann: estudio diagnostico en seis enfermos.
Autor(es): Quiroga T, Mezzano D, Aranda E, Montecinos M, Foradori A, Bull P, Schuh W, Morales M & Vargas L
Año: 1985. 113: 1076-1083.
Revista Médica de Chile
33 - Antigen engineering in yeast: synthesis and assembly of hybrid hepatitis B surface antigen-herpes simplex IgD particles
Autor(es): Valenzuela P, Coit D, Medina-Selby MA, Kuo CH, Van Nest G, Burke RL, Bull P, Urdea MS & Graves PV
Año: 1985. 3: 323-326.
Biotechnology
34 - Electron microscopy mapping of E. coli RNA polymerase binding sites on plasmids from thermophilic bacteria
Autor(es): Gonzalez B, Vasquez C, Bull P & Vicuña R
Año: 1985 80(B): 485-487.
DNA
35 - Nucleotide sequence of a yeast tRNAarg gene and its transcription in an homologous in vitro system.
Autor(es): Villanueva J, Bull P, Valenzuela P & Venegas A
Año: 1984. 167: 165-169.
FEBS Letters
36 - Mutagenic activity in stones from a patient with a congenital choledochal cyst
Autor(es): Bull P, Guzman S & Nervi F
Año: 1984. 107: 61-63.
Journal of Cancer Research & Clinical Oncology
37 - Isolation and structure of a yeast initiator tRNAmet gene
Autor(es): Venegas A, Gonzalez E, Bull P & Valenzuela P
Año: 1982. 10: 1093-1096.
Nucleic Acids Research
38 - Structure of yeast RNA polymerases determined by electron microscopy
Autor(es): Bull P and Garrido J
Año: 1982. 219: 163-166.
Archives of Biochemistry and Biophysics
39 - The reactivity of sulfhydryl groups of yeast DNA dependent RNA polymerase I
Autor(es): Bull P, Wyneken U & Valenzuela P
Año: 1982. 10: 5149-5160.
Nucleic Acids Research
40 - Structure of the eucaryotic genome: a unique pseudogene lacking introns and poly A tail as a member of the human beta-tubulin gene family
Autor(es): Pichuantes S, Medina A, Bell G, Gomez I, Valenzuela P, Bull P & Venegas A
Año: 1982. 15: 381-394.
Archivos De Biologia Y Medicina Experimentales

Paulina Bull

Fono oficina: (56-2) 354-2669

Profesor Asociado

Laboratorio de Bioquímica

Estudios

Premios y Distinciones

Cursos

Líneas de Investigación

BUSQUEDA DEL DOMINIO DE TRANSACTIVACION DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION PCACEI DE PHANEROCHAETE CHRYSOSPORIUM Y DE CSACE DE CERIPORIOPSIS SUBVERMISPORA

1 - Production of a heterologus recombinant protein using fragments of the glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase promoter from Penicillium camemberti.

2 - The PcACE1 transcription factor from Phanerochaete chrysosporium contains a Cys- and Ser-rich transactivation domain.

3 - Synaptic clustering of PSD-95 is regulated by c-Abl through tyrosine phosphorylation

4 - Reactive oxygen species potentiate the P2X2 receptor activity through intracellular Cys430

5 - The copper-dependent ACE1 transcription factor activates the transcription of the mco1 gene from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium

6 - Functional analysis of the endoxylanase B (xynB) promoter from Penicillium purpurogenum.

7 - Differential role of extracellular histidines in copper, zinc, magnesium and proton modulation of the P2X7 purinergic receptor

8 - The half-life of the T-cell receptor/peptide-major histocompatibility complex interaction can modulate T-cell activation in response to bacterial challenge

9 - Dissecting the facilitator and inhibitor allosteric metal sites of the P2X4 receptor channel: critical roles of Cys-132 for zinc-potentiation and Asp-138 for copper-inhibition

10 - Penicilium purpugerum produces a family 1 acetyl xylan esterase containing a carbohydrate-binding module: characterization of the protein and its gene

11 - The xylanolytic enzyme system from the genus Penicillium

12 - Galectin-8 binds specific beta 1 integrins and induces polarizad spreading highlighted by asymmetric lamellipodia in Jurkat T cells

13 - Extracellular histidine residues identify common structural determinants in the copper/zinc P2X2 receptor modulation

14 - 4-Bromo-2,5-dimethoxyphenethylamine (2C-B) and structurally related phenylethylamines are potent 5-HT2A receptor antagonists in Xenopus laevis oocytes

15 - The acetyl xylan esterase II gene from Penicillium purpurogenum is differentially expressed in several carbon sources, and tightly regulaterd by pH

16 - Characterization of an a-L-arabinofuranosidase gene (abf1) from Penicillium purpurogenum and its expression

17 - Histidine 140 plays a key role in the inhibitory modulation of the P2X4 nucleotide receptor by copper but not zinc

18 - Differences in expression of two endoxylanase genes (xynA and xynB) from Penicillium purpurogenum

19 - Secretion of endoxylanase A from Penicillium purpurogenum by Saccharomyces cerevisiae transformed with genomic fungal DNA

20 - Structure analysis of the endoxylanase A gene from Penicillium purpurogenum

21 - Expression of GnRH receptor in mouse and rat testicular germ cells

22 - Increased expression of c-rel, from the NF-kappaB/Rel family, in T cells from patients with systemic lupus erythematosus

23 - Apical Sorting of hepatitis B surface antigen (HBsAg) is independent on N-Glycosylation and GPI-anchored protein segregation

24 - Novel genetic markers of rheumatoid arthritis in Chilean patients revealed by DR-serotyping and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis

25 - RelB, a new transcription activator of the Rel family which interacts with p50-NF-kB

26 - The mouse c-rel protein has an N-terminal regulatory domain and a C-terminal transcriptional transactivation domain

27 - Transcriptional induction of the murine c-rel gene with serum and phorbol-12-myristate-13-acetate in fibroblasts

28 - Binding of BAL 31 RNA polymerase to PM2 DNA as determined by electron microscopy and protection against restriction endonuclease cleavage

29 - The yeast tRNAphe gene family: structures and transcriptional activities reveal member differences not explained by intragenic promoters

30 - Factores de riesgo del cancer de la via biliar

31 - Mutagenic substances in red and white wine in Chile, a high risk area for gastric cancer

32 - Enfermedad de Glanzmann: estudio diagnostico en seis enfermos.

33 - Antigen engineering in yeast: synthesis and assembly of hybrid hepatitis B surface antigen-herpes simplex IgD particles

34 - Electron microscopy mapping of E. coli RNA polymerase binding sites on plasmids from thermophilic bacteria

35 - Nucleotide sequence of a yeast tRNAarg gene and its transcription in an homologous in vitro system.

36 - Mutagenic activity in stones from a patient with a congenital choledochal cyst

37 - Isolation and structure of a yeast initiator tRNAmet gene

38 - Structure of yeast RNA polymerases determined by electron microscopy

39 - The reactivity of sulfhydryl groups of yeast DNA dependent RNA polymerase I

40 - Structure of the eucaryotic genome: a unique pseudogene lacking introns and poly A tail as a member of the human beta-tubulin gene family

41 - The interaction of yeast RNA polymerase I and Cibacron Blue F3GA

42 - Chemical modification of lysyl and cysteinyl residues of yeast polymerase I

43 - Subcellular distribution of acid sterol ester hydrolase in human liver

44 - The effect of pH on structure and activity of yeast RNA polymerase I

45 - The pH dependence of rat liver RNA polymerases I and II

46 - Subunits of yeast RNA polymerase I involved in the interactions with DNA and nucleotides

47 - Inactivation of E. coli RNA polymerase by pyridoxal 5' phosphate. Identification of a low pKa lysine as the modified residue

48 - Inactivation of rat liver RNA polymerases I and II and yeast RNA polymerase I by pyridoxal 5' phosphate. Evidence for the participation of lysyl residues at the active site